日本方面在長崎縣附近海域巡邏時，發現一艘中國漁船進入他們聲稱的經濟專屬區範圍。巡邏船發出信號，要求對方停船接受檢查，但中國船隻沒有立刻服從，而是試圖離開現場。這導致日方採取行動，登上船隻並控制局面。船長被帶走，船上其他成員暫時留在船上等待處理。整個過程發生在2月12日中午前後，日本漁業廳發佈消息解釋了他們的理由，強調這是因爲船隻不配合檢查。
中國外交部很快做出反應，在2月13日的例行記者會上，發言人指出日方需要嚴格按照中日之間關於漁業方面的約定辦事，確保中國船員的權益不受損害。中國駐福岡總領館也介入，派人去協助處理相關事宜，幫助船員們協調後續。日方在收到一份書面承諾後，當天晚上就放了船長，讓他離開拘留地點。船員們隨後也陸續返回船上，準備離開日本港口。
這個事件不是孤立的，日本漁業廳過去幾年裏也處理過類似情況，比如在2025年時檢查過韓國和臺灣的船隻。作爲回應，中國方面一直不承認日本單方面劃定的那個經濟專屬區，認爲這沒有得到廣泛認可。日本還是堅持自己的執法，在周邊海域加強巡查，針對外國船隻的行動越來越多。
中日關係在這個節點上本來就挺緊繃的，因爲日本首相高市早苗之前在議會里談及臺灣事務時，說了些讓北京不滿的話。中國駐日大使吳江浩公開表示，雙邊關係已經到了邦交正常化以來最難的階段。在這種背景下，日本扣押中國漁船的舉動容易被看作是火上澆油，雖然最後快速釋放了人，但整個過程還是加劇了雙方的不信任。
釋放船長之後，日本媒體報道了海上保安廳對本國漁民的提醒，建議他們別靠近釣魚島周邊海域幹活。這個消息在2月13日由共同社放出，保安廳是通過非正式渠道跟漁民溝通的，說是爲了避免不必要的麻煩。實際上，這個提醒不是新鮮事，幾個月前就發過了，但在這個時機又被拿出來說，感覺像是在借題發揮。
去年12月2日，有艘日本漁船叫“瑞寶丸”號進了釣魚島領海，中國海警發出警告後把它驅離了。那次事件後，日本漁民在那片海域的活動就少了些。保安廳的提醒跟這個有關係，他們擔心自家船隻被中國扣押，尤其是在關係這麼敏感的時候。釣魚島那片水域魚多，但風險也大，日本漁船過去在那作業的也就那麼幾艘，現在被勸着別去了。
中國漁船被扣的地點離釣魚島不算太近，但整個東海海域的爭議一直存在。日本聲稱那個經濟專屬區是他們的，但中國從不接受這個劃分。類似扣押事件在歷史上不是頭一回，2010年時，日本扣過一艘中國漁船，船長被關了十幾天，最後無罪釋放。那次鬧得挺大，影響了雙邊交流。這回扣押時間短，只有一天，可能是考慮到當前形勢，不想把事鬧大。
日本漁業廳的統計顯示，他們這些年扣押的外籍船隻不少，主要來自周邊國家。韓國船最多，其次是中國大陸和臺灣的，還有俄羅斯的。日本強調這是爲了打擊非法捕魚，但中國覺得這是針對性的執法，尤其是在敏感海域。去年5月，日本扣過一艘臺灣漁船，那次也引起了不滿。
海上保安廳對漁民的提醒，通常是私下裏說，不搞正式通告。但在釋放中國船長後，又高調報道這個，可能是想在輿論上佔點便宜，擺出受害者的樣子。實際上，日本漁船去年還闖過釣魚島領海，被中國海警趕走。這說明日方並沒有完全放棄在那邊的活動，只是讓漁民小心點，別惹麻煩。
