這事兒發生在3月24日上午，一名日本現役軍官從相鄰建築翻牆進入中國駐日本大使館的院區。使館工作人員發現後立刻上前控制住他，整個過程沒有造成任何人受傷。使館方面隨後通知了日本警方，警方趕到現場後將這名軍官帶走處理。
當天中午前後，中國駐日使館向日方提出嚴正交涉。中方明確表示，這起事件嚴重威脅外交人員安全，性質非常惡劣，已經違反了相關國際公約。中方要求日方馬上徹查到底，嚴肅處理涉事人員，並且給出負責任的交代。下午，中國外交部發言人林劍在例行記者會上再次公開表態，重申了中方的強烈不滿和抗議立場，強調必須立即採取措施保障使館和人員安全。
日方一開始的反應比較慢。警方在現場控制住人之後，先進行了初步調查，確認了這名闖入者的身份是陸上自衛隊現役軍官，隸屬於宮崎縣的蝦野駐屯地。警方還從使館院內草叢位置找到了一把刀具，據調查是這名軍官帶進去的。軍官本人承認了闖入行爲，說目的是想當面向大使表達意見，如果意見不被接受就打算自我了斷。整個調查過程在3月24日白天持續進行，但日方沒有馬上對外公佈全部細節。
到了3月24日深夜11點左右，日本東京警視廳正式完成逮捕手續，對外確認了闖入者的軍官身份。這一步行動可以說是日方在承受中方抗議壓力後不得不採取的措施。因爲從中方提出交涉開始，日方就面臨着來自國際層面的關注，如果不盡快處理，局面會更被動。警方以涉嫌非法侵入建築物爲由逮捕了他，整個逮捕流程在夜間推進，確保了程序上的完成。
3月25日，日本內閣官房長官木原稔在記者會上公開表示，這起事件讓人感到遺憾。他強調，本來肩負維護法律職責的自衛隊員卻涉嫌非法闖入，確實不應該發生。日本政府還向中方說明了情況，承諾相關部門會按照國際法和國內法律採取適當措施，包括防止類似事件再次發生。東京警視廳也同時宣佈，會對中國駐日使館周邊實施24小時警戒，加強安保力量，巡邏車輛和人員在使館外持續駐守。
日本陸上自衛隊方面也在3月25日表態，說自衛官被逮捕這件事讓人遺憾。他們表示會全面配合警方調查，在事實清楚的基礎上嚴肅處理涉事人員。防衛省內部開始確認相關情況，檢查這名軍官是怎麼離開駐地的。據瞭解，他在前一天也就是3月23日未經許可就離開了駐屯地，獨自前往東京，準備了行動所需的東西。
中方在整個過程中保持了剋制但堅定的態度。林劍在記者會上的表態直接點出了事件的嚴重性，要求日方不能敷衍了事，必須給出一個負責任的結果。這次抗議不是空談，中方把事件通報給了國際社會，讓日方沒有迴旋的餘地。日方從最初的低調應對，到深夜完成逮捕，再到第二天公開遺憾和加強安保，整個過程顯示出他們在中方壓力下逐步調整了立場。
3月26日，東京警視廳將這名軍官移送給檢方，案件進入司法程序。移送當天，警方做好了手續交接，檢察機關開始正式審查證據，包括闖入時的行動記錄和找到的刀具。日本政府繼續在官方層面重申遺憾態度，警視廳則維持了對使館周邊的強化警戒，確保安全措施落實到位。
從事件發生到移送檢方，這一系列發展都圍繞着中方提出的核心要求展開。中方抗議後，日方扛不住壓力，在深夜採取了逮捕行動，確認身份並對外公佈。後續的安保加強和配合調查，都是日方爲了回應交涉而做的實際步驟。整個過程沒有出現任何人員傷亡，使館正常秩序在事後很快恢復，但安保級別明顯提升了。
這起事件讓中日雙方在外交層面有了直接互動。中方通過正式渠道表達了不滿，日方則通過官方表態和行動顯示出重視。警方在逮捕後的調查中確認了軍官的供述內容，但沒有改變事件的基本性質。陸上自衛隊配合調查的承諾，也讓後續處理有了明確方向。
