這起事件發生在3月24日上午，一名日本自衛隊現役軍官從使館周邊建築翻越圍牆進入中國駐日本大使館區域。使館人員發現後立刻把他控制住，整個過程沒有造成任何人受傷。使館方面隨即對他展開詢問，從上午開始一直持續了3個小時左右。在詢問過程中，這名軍官的身份信息和行動細節被全面覈實。他承認自己行爲非法，還交代了攜帶刀具進入使館的目的，據他所說，是想當面向大使表達意見，如果意見不被接受就準備採取自殺方式。
通過這3小時的詢問，他的全部情況都清楚了，包括他是單獨行動，沒有任何外部人員指使或協助。這些信息讓使館方面掌握了事件的完整脈絡。詢問結束後，使館按照程序聯繫了日本警方，日本警方隨後以涉嫌非法侵入建築物爲由把他帶走並正式逮捕。警方在現場也發現了那把刀具，進一步確認了事件的相關證據。
3月24日下午，中國外交部發言人林劍在例行記者會上就此事進行了回應。他表示中方對這名自稱爲日本自衛隊現役官員的不法之徒翻牆強行闖入使館的行爲深感震驚，已經向日方嚴正交涉並提出強烈抗議。林劍指出，這個事件嚴重違反了維也納外交關係公約，嚴重威脅到了中方外交人員的人身安全和外交設施的安全，性質影響極爲惡劣。他還直接強調，這一事件再次反映出日本國內極右翼思潮和勢力十分猖獗，新型軍國主義正在成勢爲患，也暴露了日本政府在歷史和臺灣等涉及中日關係重大核心問題上的錯誤政策流毒深重，日方對自衛隊人員存在失管失教的情況，未能履行好對中國使領館和外交人員的安保責任。
林劍在回應中要求日方立即徹查事件，嚴懲有關人員，給中方一個負責任的交代。同時，他敦促日方必須切實保障中國駐日使領館館舍及人員安全，在對華政策上反思糾錯，從根本上杜絕此類事件再次發生。國際社會也應該高度警惕日本國內加速右傾化和自衛隊擴軍失管的危險動向。這些表態把事件的本質和背後的隱患說得明明白白，沒有繞彎子。
日本方面在事件發生後也做出了反應。3月25日，日本內閣官房長官木原稔在記者會上表示，一名本應遵守法律的自衛隊人員因涉嫌非法闖入被捕，實在令人感到遺憾。他確認中方已經提出交涉，並要求杜絕類似事件再次發生。木原稔提到，日方已經向中方說明，將依據相關國際法和日本國內法律，由政府相關部門展開協作，包括採取防止再次發生的適當措施。他還表示，已經增派了負責使館警戒的警力，並會根據調查中查明的事項做好應對。
日本自衛隊方面同樣表態，會全面配合警方調查，並在查明事實基礎上嚴肅處理涉事人員。東京警視廳在事件後對中國駐日使館實施了24小時巡邏安保，以加強周邊防護。這些舉措是日方在事件發生後的直接回應。
3月26日，這名軍官被日本警方移送到了檢察機關，繼續按照法律程序接受審查。整個過程從使館控制到警方逮捕，再到後續移送，都嚴格按照既有流程推進，沒有出現新的情況。使館方面也與日本警方保持協調，處理後續事宜。
